Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAB2O43741 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms