Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEFVO15553 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEFVO15553 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEFVO15553 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEFVO15553 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEFVO15553 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MEFVO15553 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MEFVO15553 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MEFVO15553 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MEFVO15553 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MEFVO15553 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms