Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPATO15228 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPATO15228 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPATO15228 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPATO15228 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GNPATO15228 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GNPATO15228 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GNPATO15228 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms