Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNMO15061 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNMO15061 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNMO15061 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNMO15061 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNMO15061 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms