Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms