Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PMD0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PMD0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PMD0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PMD0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PMD0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms