Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF2D3W0D1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF2D3W0D1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms