Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms