Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms