Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4E171 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4E171 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4E171 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B4E171 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B4E171 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B4E171 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B4E171 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms