Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIPT2A6NK58 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms