Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms