Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms