Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms