Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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