Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRMP28827 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRMP28827 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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