Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms