Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL4A6Q14031 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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COL4A6Q14031 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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COL4A6Q14031 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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COL4A6Q14031 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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COL4A6Q14031 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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COL4A6Q14031 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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COL4A6Q14031 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL4A6Q14031 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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