Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
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