Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104316.2-201ENST00000559049 326 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092120.2-201ENST00000567166 415 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356458.1-201ENST00000604764 465 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL591926.2-201ENST00000611780 500 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.140-201ENST00000613842 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011483.4-201ENST00000623621 585 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PKP4-218ENST00000629219 162 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIK3-201ENST00000373091 9101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01310-201ENST00000380981 4015 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TCN2-205ENST00000450638 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FBLN5-201ENST00000267620 2423 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105105.1-201ENST00000591360 2553 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms