Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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