Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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CDH18Q13634 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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CDH18Q13634 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CDH18Q13634 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CDH18Q13634 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CDH18Q13634 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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