Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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