Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms