Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms