Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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