Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRHP20396 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRHP20396 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TRHP20396 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms