Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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USP35Q9P2H5 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP35Q9P2H5 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP35Q9P2H5 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP35Q9P2H5 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP35Q9P2H5 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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