Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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