Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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RPE65Q16518 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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