Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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