Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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