Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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