Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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