Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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RYR3Q15413 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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