Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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