Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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