Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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NME3Q13232 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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NME3Q13232 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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NME3Q13232 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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NME3Q13232 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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NME3Q13232 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NME3Q13232 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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