Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD12P35452 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms