Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC96Q2M329 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC96Q2M329 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC96Q2M329 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC96Q2M329 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC96Q2M329 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC96Q2M329 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC96Q2M329 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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