Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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