Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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