Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PTGS1-203ENST00000373698 4987 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01304-204ENST00000454455 2454 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CA5B-204ENST00000454127 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MSL3P1-201ENST00000438684 2032 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TXNRD1-204ENST00000429002 3855 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RIPOR2-201ENST00000259698 5471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC9B2-204ENST00000503230 1826 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 IGSF11-203ENST00000425327 3525 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 B3GALNT1-201ENST00000320474 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01929-201ENST00000589125 3067 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TRPV1-207ENST00000572705 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC244157.1-201ENST00000415642 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL136529.1-201ENST00000430540 610 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms