Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms