Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms