Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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