Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TCOF1Q13428 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TCOF1Q13428 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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TCOF1Q13428 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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