Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CENPFP49454 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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CENPFP49454 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CENPFP49454 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CENPFP49454 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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