Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms