Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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